Schrijf je in voor onze dagelijkse nieuwsbrief om al het laatste nieuws direct per e-mail te ontvangen!

Inschrijven Ik ben al ingeschreven

U maakt gebruik van software die onze advertenties blokkeert (adblocker).

Omdat wij het nieuws gratis aanbieden zijn wij afhankelijk van banner-inkomsten. Schakel dus uw adblocker uit en herlaad de pagina om deze site te blijven gebruiken.
Bedankt!

Klik hier voor een uitleg over het uitzetten van uw adblocker.

Meld je nu aan voor onze dagelijkse nieuwsbrief en blijf up-to-date met al het laatste nieuws!

Abonneren Ik ben al ingeschreven

Eerste commerciële aarbeigenoom samengesteld

NRGene, een wereldwijde erkend bedrijf in gnomische analyse, heeft een grote primeur. Het kan namelijk de complexe genoom van de commerciële aardbei samenstellen. 

De meeste plantaardige, dierlijke en menselijke genomen zijn diploïde d.w.z. ze bevatten 2 varianten van ieder gen. De aardbei bevat wel 8 bijna identieke kopieën van ieder gen. Dit is waarom het nog nooit eerder gelukt was dit genoom samen te stellen tot de ontwikkeling van de DeNovoMAGICTM 3.0 van NRGene. 

Het aardbeigenoom is samengesteld met gebruik van de Illumina sequentiereactie technologie. Het is daarna in 2 weken tijd samengesteld door de DeNovoMAGICTM 3.0 software.



"Het is bijzonder om te zien hoe de analyse van NRGene samen met de data van Illumina sequentiereacties gebruikt kan worden om snel én betaalbaar complexe genomen samen te stellen zoals die van de aardbei," zegt Ryan Rapp, onderdirecteur Agrigenomics voor Illumina. "We hopen dat deze technologie genomica toegankelijk maakt voor landbouwonderzoekers wereldwijd. Het kan helpen om het aanbod van voedsel te verbeteren en te zorgen dat het duurzamer en efficiënter wordt."

De DeNovoMAGICTM 3.0 van NRGene levert complete en nauwkeurige genoomsamenstellingen in de vorm van lange, gefaseerde sequenties met gebruik van interpretaties van Illumina. Wanneer er meer genomen samengesteld worden, wordt de PanMAGICTM van NRGene gebruikt om de complete genoomsequentie van meerdere individuele monsters in kaart te brengen. Hiermee kan men de bredere genoomdiversiteit zien en aanwijzen wat de positieve eigenschappen zijn voor alle variëteiten.

"Met de data van NRGene kunnen aardbeientelers sneller betere variëteiten uitbrengen. Ze kunnen dan sterkere en meer ziekteresistente variëteiten met langere houdbaarheid creëren," zegt Saschiko Isobe, hoofd van plant genomica en genetica laboratorium bij het Japanese Kazusa DNA Onderzoeksinstituut. 

"Deze samenstelling toont aan dat zelfs de meest complexe genomen snel en nauwkeurig in kaart gebracht kunnen worden," zegt Gil Ronen, CEO van NRGene. "De ultieme waarde van onze technologie is dat het gebruikt kan worden voor de analyse en samenstelling van genomen in welke soort dan ook."

Gedetailleerde resultaten zijn beschikbaar op: nrgene.com/strawberry-results/

Het project is uitgevoerd in samenwerking met het Japanse Kazusa DNA Onderzoeksinstituut en werd deels ondersteund door het Japanse Ministerie van Landbouw, Bosbouw en Visserij. 

Voor meer informatie:
NRGene
Tel +972.72.2203750
Fax +972.8.6489897
Publicatiedatum: