Perchloraten worden industrieel onder andere ingezet als brandstof voor raketten en vuurwerk. Ze komen echter ook natuurlijk voor, bijvoorbeeld in natriumnitraat dat vaak gebruikt wordt als bestanddeel van bemestingsmiddelen. Het gebruik in bemestingsmiddelen geldt ook als de waarschijnlijkste oorzaak voor de aanwezigheid van perchloraatresten in groenten en fruit.
In het levensmiddel- en veterinairinstituut Oldenburg (LVI) werden onder meer aardbeien, kersen, sla, asperges, tomaten en kruiden onderzocht op de aanwezigheid van perchloraat. Bij in totaal 43 monsters (29%) kon perchloraat aangetoond worden. De hoogste perchloraatwaarden (4,56 mg/kg en 3,02 mg/kg) werden gemeten in twee monsters van kropsla uit conventionele teelt. Alleen deze twee monsters overschreden de maximaal toegestane hoeveelheid perchloraat.
De opname van grote hoeveelheden perchloraat kan de jodiumopname in de schildklier beïnvloeden en daarmee de productie van schildklierhormonen remmen. Dit effect is echter omkeerbaar, zo deelde het Duits Instituut voor Risicobeoordeling (BfR) mee.